Rok: 1999
Thomas A. Anderson (Keanu Reeves), známý pod přezdívkou Neo, je hacker. Jednoho dne se dozví, že celý jeho život je jenom klam. Ve skutečnosti je jako všichni ostatní lidé v jakési nádrži a slouží jako zdroj energie pro stroje, které vyhladily lidstvo. To, co lidé považují za skutečnost, je jenom takzvaný Matrix, iluze života. Skupince lidí vedených Morfeem (Laurence Fishburne) se podařilo z tohoto zajetí vymanit vedou rebelii proti strojům v raketě vybavené moderními počítači, pomocí kterých mohou vyvolat jakoukoli simulaci nebo se napojit na Matrix. Jakýmisi hlídači Matrixu jsou agenti Smithové, které zatím nikdo neporazil. Morfeus považuje Nea za vyvoleného a věří, že dokáže lidstvo vyvést z otroctví.